县人民政府驻龙津镇，全县辖7个镇、6个乡：龙津镇、嵩溪镇、嵩口镇、灵地镇、长校镇、赖坊镇、林畲镇、温郊乡、田源乡、沙芜乡、余朋乡、李家乡、里田乡。

　　1995年，清流县辖龙津镇、嵩口镇、嵩溪镇、林畲乡、温郊乡、沙芜乡、东华乡、赖坊乡、邓家乡、灵地乡、李家乡、长校乡、里田乡、田源乡、余朋乡，5个居委会、108个行政村。

　　1997年，清流县面积1825平方千米，人口14万，辖5个镇、10个乡：龙津镇、嵩口镇、嵩溪镇、灵地镇、长校镇、东华乡、林畲乡、温郊乡、余朋乡、沙芜乡、赖坊乡、邓家乡、李家乡、里田乡、田源乡。县府驻龙津镇。

　　2000年，根据第五次人口普查数据，全县总人口135669人，其中：龙津镇21822人、嵩溪镇15590人、嵩口镇15427人、灵地镇6142 人、长校镇11278人、东华乡9279人、温郊乡4078人、林畲乡9522人、田源乡6019人、沙芜乡3841人、赖坊乡7835人、余朋乡 5635人、邓家乡4990人、李家乡8785人、里田乡5417人。

　　2003年末，清流县辖5个镇、10个乡：龙津镇、嵩口镇、嵩溪镇、灵地镇、长校镇、东华乡、林畲乡、温郊乡、余朋乡、沙芜乡、赖坊乡、邓家乡、李家乡、里田乡、田源乡。全县户籍人口14.70万人，其中非农业人口3.39万人。

　　2005年，清流县辖5个镇、10个乡：龙津镇、嵩溪镇、嵩口镇、灵地镇、长校镇、东华乡、温郊乡、林畲乡、田源乡、沙芜乡、赖坊乡、余朋乡、邓家乡、李家乡、里田乡。

　　2006年9月25日，福建省政府《关于同意清流县撤销东华乡并入龙津镇的批复》（闽政文[2006]441号）：同意清流县撤销东华乡，现有东华乡并入龙津镇。合并后的龙津镇辖城东、城南、蔬菜、大路口、严坊、横溪、南岐、桥下、供坊、俞坊、暖水、基头、下戈、拔里14个行政村和渔沧、长兴、凤翔、翠园 4社区，镇政府驻现东华乡政府驻地长兴南街17号。全县辖5个镇、9个乡：龙津镇、嵩溪镇、嵩口镇、灵地镇、长校镇、温郊乡、林畲乡、田源乡、沙芜乡、 赖坊乡、余朋乡、邓家乡、李家乡、里田乡。

　　2007年12月14日，福建省政府《关于清流县邓家乡并入灵地镇的批复》（闽政文[2007]438号）：同意清流县撤销邓家乡，现有邓家乡并入灵地镇。合并后的灵地镇辖灵地、灵和、青甲、杨源、姚坊、大坪、步云、邓家、田中、马寨、尤坊甲、吉龙、坑甲、古洋14个行政村，镇政府驻现灵地镇政府驻地 （群英街52号）。（三明市政府批文：12月28日明政文[2007]177号《关于清流县灵地镇与邓家乡合并的批复》）

　　2011年末，清流县辖龙津、嵩口、嵩溪、灵地、长校5个镇，林畲、温郊、余朋、沙芜、赖坊、李家、里田、田源8个乡，共13个乡镇；辖有8个社区居民委员会、111个社区；下设49个居民小组、893个村民小组。

　　2014年,全县为5镇8乡111个村民委员会和8个社区。下设49个居民小组、893个村民小组。

　　2017年，赖坊乡撤乡改镇为赖坊镇。

　　2018年，林畲乡撤乡改镇为林畲镇。 

　　2023年行政区划

　　人口、人民生活 2022年年末全县总人口（户籍人口）为151148人，较上年减少989人，其中男性79732人，女性71416人。全县人口出生率5.90‰，死亡率5.03‰，自然增长率0.87‰。城乡居民生活水平继续提高，全县全体居民人均可支配收入28870元，增长5.7%；城镇居民人均可支配收入38829元，增长4.9%；农村居民人均可支配收入22080元，增长7.1%。年末参加企业基本养老保险参保人数21397人；参加职工医疗保险人数1.58万人，比上年增长2.6%；享受政府最低生活保障的城镇居民226人，享受低保的农村居民2855人,享受城乡特困人员保障338人。

　　民族  县域总人口中，以汉族为主，占97.95%。少数民族有畲族、土家族、回族、苗族、高山族、彝族等24个，共3199人，约占总人口2.05%。人口相对较多的少数民族为畲族，有2589人，主要分布在龙津、嵩溪、嵩口、林畬、余朋等12个乡镇；土家族186人，主要分布在林畬、龙津、嵩口、嵩溪、田源、里田等9个乡镇；回族111人，主要分布在以龙津为主的6个乡镇；苗族101人，主要分布在林畬、田源、龙津为主的10个乡镇；高山族51人，主要分布在龙津镇为主的3个乡镇；彝族40人，主要分布在林畬、嵩口、余朋等5个乡镇；侗族25人，主要分布在龙津、嵩溪、李家、林畬为主的9个乡镇。布依族21人、主要分布在龙津、林畬为主的5个乡镇。瑶族18人，主要分布在龙津、林畬、沙芜、灵地、李家5个乡镇；其他依次有土族12人，白族8人，纳西族6人，蒙古族5人，水族、黎族各4人、藏族、傣族各3人，朝鲜族、仡佬族、佤族、东乡族、羌族各2人，维吾尔族、拉祜族各1人。